ด้วยกองบังคับการปราบปราม กองบัญชาการตำรวจสอบสวนกลาง โดยการอำนวยการสั่งการของ พล.ต.ต.จิรภพ ภูริเดช ผบก.ป., พ.ต.อ.สมควร พึ่งทรัพย์ รอง ผบก.ป. สั่งการให้ พ.ต.อ.เนติ วงษ์กุหลาบ ผกก 5 บก.ป., พ.ต.ท.ภูวนนท์ สมัครไทย รอง ผกก.๕ บก.ป.
เจ้าหน้าที่ตำรวจชุดจับกุมนำโดย พ.ต.ท.นิธิ ตรีสุวรรณ สว.กก.5 บก.ป. พร้อมด้วย ร.ต.ท.วชิรเชษฐ์ อัครธีระพงศ์ รองสว.กก.5 บก.ป, ด.ต.พงษ์ธร สุขเกษม, ส.ต.ท.ณัฐดนัย ภาลา และ ส.ต.ท.ภาคภูมิ อินทร์พรหม ผบ.หมู่ กก.5 บก.ป.
ได้ร่วมกันจับกุมตัว นายกชกร หรือ ชินภัทร (สงวนนามสกุล) อายุ 41 ปี ผู้ต้องหาตามหมายจับศาลอาญากรุงเทพใต้ ที่ จ.877/2546 ลงวันที่ 22 พฤษภาคม 2546 ซึ่งต้องหาว่ากระทำความผิดฐาน “พาไปเพื่อการอนาจารโดยใช้กำลังประทุษร้าย และข่มขืนกระทำชำเราหญิงซึ่งมิใช่ภริยาของตน โดยขู่เข็ญด้วยประการใดๆ โดยใช้กำลังประทุษร้าย โดยหญิงอยู่ในภาวะไม่สามารถขัดขืนได้”
พฤติการณ์แห่งคดี ก่อนเกิดเหตุ นายกชกร หรือ ชินภัทรฯ ผู้ต้องหา ได้ทำงานที่สถานบริการ (บาร์เหล้า) แห่งหนึ่งย่านสยามสแควร์ ต่อมาได้มี น.ส.บี (นามสมมุติ) ผู้เสียหาย เข้ามาทำงานในตำแหน่งพนักงานฝึกงาน โดยขณะนั้นผู้เสียหายมีอายุ 18 ปี ซึ่งผู้เสียหายมีลักษณะรูปร่างหน้าตาดี ทำให้ตัวผู้ต้องหาเกิดความสนใจ และพยายามทำความรู้จักกับผู้เสียหายจนเกิดความสนิทสนมกัน
ต่อมาเมื่อวันที่ 1 เม.ย.46 ผู้ต้องหาได้ออกอุบายพาผู้เสียหายไปดื่มสุราที่สถานบริการแห่งหนึ่ง แล้วได้มอมเหล้าผู้เสียหายจนผู้เสียหายไม่ได้สติ จากนั้นผู้ต้องหาได้พาผู้เสียหายไปยังห้องพักของตนย่านปทุมวัน แล้วข่มขืนผู้เสียหายในขณะที่ผู้เสียหายเมาไม่ได้สติ หลังจากนั้นผู้เสียหายจึงเดินทางเข้าแจ้งความร้องทุกข์ต่อพนักงานสอบสวน สน.ปทุมวัน เพื่อดำเนินคดีตามกฎหมาย
จนกระทั่งวันที่ 25 ก.พ.63 เวลาประมาณ 15.00 น. เจ้าหน้าที่ชุดจับกุมได้สืบสวนติดตามผู้ต้องหาจนทราบว่า ผู้ต้องหาได้หลบหนีมาพักอาศัยอยู่ที่บริเวณแฟลตห้วยขวาง ถ.ประชาสงเคราะห์ แขวงดินแดง เขตดินแดง กรุงเทพฯ เจ้าหน้าที่ตำรวจชุดจับกุมจึงได้ลงพื้นที่เพื่อทำการตรวจสอบติดตามจับกุมตัวผู้ต้องหา พบ นายกชกร หรือ ชินภัทรฯ ผู้ต้องหา อยู่บริเวณดังกล่าว จึงได้ร่วมกันแสดงตนเป็นเจ้าหน้าที่ตำรวจ และแสดงหมายจับให้ นายกชกร หรือ ชินภัทรฯ ดูและอ่านจนเข้าใจดีแล้ว จึงนำตัวผู้ต้องหาส่งพนักงานสอบสวน สน.ปทุมวัน เพื่อดำเนินคดีตามกฎหมายต่อไป